第一代指紋系技術采用光學識技術，由于光不能穿透皮膚表層（死性皮膚層），所以只能夠掃描手指皮膚的表面，或者掃描到死性皮膚層，但不能深入真皮層。在這種情況下，手指表面的干凈程度，直接影響到識別的效果。
第二代指紋識別采用電容傳感器技術，利用硅晶元與導電的皮下電解液形成電場，指紋的高低起伏會導致二者之間的壓差出現不同的變化，借此可實現準確的指紋測定。但是由于傳感器表面是使用硅材料容易損壞，導致使用壽命降低。以及通過指紋的山谷和山脊之間的凹凸來形成指紋圖像的，因而對臟手指或濕手指等困難手指識別率低。
第三代指紋識別采用射頻技術，分為無線電波探測與超聲波探測兩種，其原理都與探測海底物質的的聲納類似，是靠特定頻率的信號反射來探知指紋的具體形態的。
